Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SETD1AO15047 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SETD1AO15047 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms