Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RGPD8O14715 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RGPD8O14715 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms