Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BHLHE40O14503 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms