Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC01387J3KSC0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC01387J3KSC0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms