Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00587B1AMM8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00587B1AMM8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00587B1AMM8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms