Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NOTOA8MTQ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms