Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF2Q9Y5W3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF2Q9Y5W3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF2Q9Y5W3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF2Q9Y5W3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF2Q9Y5W3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KLF2Q9Y5W3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms