Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO3Q9Y5L0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO3Q9Y5L0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNPO3Q9Y5L0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNPO3Q9Y5L0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNPO3Q9Y5L0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNPO3Q9Y5L0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNPO3Q9Y5L0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms