Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PIKFYVEQ9Y2I7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PIKFYVEQ9Y2I7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIKFYVEQ9Y2I7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PIKFYVEQ9Y2I7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms