Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
POMPQ9Y244 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POMPQ9Y244 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POMPQ9Y244 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POMPQ9Y244 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POMPQ9Y244 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms