Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
APOBEC2Q9Y235 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOBEC2Q9Y235 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOBEC2Q9Y235 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOBEC2Q9Y235 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOBEC2Q9Y235 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms