Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TRIM33Q9UPN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIM33Q9UPN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIM33Q9UPN9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM33Q9UPN9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIM33Q9UPN9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIM33Q9UPN9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms