Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COG5Q9UP83 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COG5Q9UP83 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
COG5Q9UP83 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COG5Q9UP83 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
COG5Q9UP83 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms