Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTF3C4Q9UKN8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTF3C4Q9UKN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF3C4Q9UKN8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF3C4Q9UKN8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF3C4Q9UKN8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GTF3C4Q9UKN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF3C4Q9UKN8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms