Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDC42EP3Q9UKI2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDC42EP3Q9UKI2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDC42EP3Q9UKI2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.4 ms