Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
CCNL1Q9UK58 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCNL1Q9UK58 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCNL1Q9UK58 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCNL1Q9UK58 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCNL1Q9UK58 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CCNL1Q9UK58 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CCNL1Q9UK58 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms