Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MCM8Q9UJA3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MCM8Q9UJA3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MCM8Q9UJA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MCM8Q9UJA3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MCM8Q9UJA3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms