Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
APOBEC3BQ9UH17 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APOBEC3BQ9UH17 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3BQ9UH17 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3BQ9UH17 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
APOBEC3BQ9UH17 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms