Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CGGBP1Q9UFW8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CGGBP1Q9UFW8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGGBP1Q9UFW8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
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