Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLN8Q9UBY8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN8Q9UBY8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLN8Q9UBY8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLN8Q9UBY8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLN8Q9UBY8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms