Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJB11Q9UBS4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJB11Q9UBS4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB11Q9UBS4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DNAJB11Q9UBS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DNAJB11Q9UBS4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms