Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPASTQ9UBP0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPASTQ9UBP0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPASTQ9UBP0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPASTQ9UBP0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPASTQ9UBP0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms