Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3BP4Q9P0V3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3BP4Q9P0V3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SH3BP4Q9P0V3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH3BP4Q9P0V3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH3BP4Q9P0V3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms