Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GSKIPQ9P0R6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSKIPQ9P0R6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GSKIPQ9P0R6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
GSKIPQ9P0R6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSKIPQ9P0R6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSKIPQ9P0R6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSKIPQ9P0R6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GSKIPQ9P0R6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms