Protein–RNA interactions for Protein: Q9P086

MED11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED11Q9P086 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MED11Q9P086 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MED11Q9P086 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MED11Q9P086 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MED11Q9P086 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MED11Q9P086 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms