Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ6

COQ3, Ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ3Q9NZJ6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COQ3Q9NZJ6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COQ3Q9NZJ6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COQ3Q9NZJ6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COQ3Q9NZJ6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ3Q9NZJ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ3Q9NZJ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COQ3Q9NZJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COQ3Q9NZJ6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms