Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBAP1Q9NZ09 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
UBAP1Q9NZ09 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBAP1Q9NZ09 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
UBAP1Q9NZ09 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBAP1Q9NZ09 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms