Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLC5A4Q9NY91 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLC5A4Q9NY91 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
SLC5A4Q9NY91 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SLC5A4Q9NY91 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SLC5A4Q9NY91 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SLC5A4Q9NY91 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SLC5A4Q9NY91 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms