Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
C1orf109Q9NX04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C1orf109Q9NX04 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
C1orf109Q9NX04 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C1orf109Q9NX04 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C1orf109Q9NX04 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms