Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 ASPH-220ENST00000522036 663 ntTSL 36.72□□□□□ -1.339e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 PAFAH1B1-205ENST00000571495 1503 ntTSL 26.12□□□□□ -1.439e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 PAFAH1B1-209ENST00000574816 662 ntTSL 55.58□□□□□ -1.529e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)4.47□□□□□ -1.699e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 ASPH-223ENST00000522349 531 ntTSL 54.46□□□□□ -1.79e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 PAFAH1B1-201ENST00000397193 1277 ntTSL 24.14□□□□□ -1.759e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 HERC1-211ENST00000560983 457 ntTSL 23.39□□□□□ -1.879e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 ASPH-210ENST00000517928 548 ntTSL 42.13□□□□□ -2.079e-12■■■■■ 49.2
RBM22Q9NW64 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.139e-12■■■■■ 49.2
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RBM22Q9NW64 RBM39-208ENST00000416108 577 ntTSL 48.57□□□□□ -1.042e-13■■■■■ 49.1
RBM22Q9NW64 RBM39-211ENST00000426951 840 ntTSL 1 (best)1.86□□□□□ -2.112e-13■■■■■ 49.1
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RBM22Q9NW64 KIF22-202ENST00000400751 2493 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.362e-11■■■■■ 49.1
RBM22Q9NW64 KIF22-204ENST00000563263 600 ntTSL 39.35□□□□□ -0.912e-11■■■■■ 49.1
RBM22Q9NW64 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-10■■■■■ 48.8
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RBM22Q9NW64 AKR1A1-208ENST00000476957 910 ntTSL 317.55■□□□□ 0.42e-10■■■■■ 48.8
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RBM22Q9NW64 AKR1A1-209ENST00000481885 516 ntTSL 316.24■□□□□ 0.192e-10■■■■■ 48.8
RBM22Q9NW64 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-10■■■■■ 48.8
RBM22Q9NW64 AKR1A1-203ENST00000434299 840 ntTSL 213.94□□□□□ -0.182e-10■■■■■ 48.8
RBM22Q9NW64 KPNA2-201ENST00000330459 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.832e-26■■■■■ 48.8
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RBM22Q9NW64 KPNA2-205ENST00000583269 611 ntTSL 45.02□□□□□ -1.612e-26■■■■■ 48.8
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RBM22Q9NW64 STAMBP-207ENST00000452725 560 ntTSL 411.59□□□□□ -0.551e-7■■■■■ 48.5
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RBM22Q9NW64 STAMBP-201ENST00000339566 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 48.5
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RBM22Q9NW64 TSEN15-205ENST00000462677 1628 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.783e-11■■■■■ 48.1
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RBM22Q9NW64 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.223e-34■■■■■ 47.5
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RBM22Q9NW64 SIRT7-217ENST00000574992 3445 ntTSL 211.23□□□□□ -0.613e-6■■■■■ 47.5
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RBM22Q9NW64 NOM1-203ENST00000469271 1209 ntTSL 1 (best)20.7■□□□□ 0.92e-16■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-16■■■■■ 47.5
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RBM22Q9NW64 FAM120A-203ENST00000427765 1710 ntTSL 1 (best)18.34■□□□□ 0.536e-9■■■■■ 47.5
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RBM22Q9NW64 NOM1-204ENST00000472491 593 ntTSL 318.13■□□□□ 0.492e-16■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 TIMM50-204ENST00000595286 698 ntTSL 217.7■□□□□ 0.426e-9■■■■■ 47.5
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RBM22Q9NW64 TIMM50-203ENST00000594583 680 ntTSL 316.99■□□□□ 0.316e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 PCNX1-209ENST00000554879 4431 ntTSL 1 (best)16.92■□□□□ 0.36e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 TIMM50-210ENST00000597782 456 ntTSL 516.75■□□□□ 0.276e-9■■■■■ 47.5
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RBM22Q9NW64 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 TIMM50-212ENST00000599733 669 ntTSL 314.16□□□□□ -0.146e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 RBM3-208ENST00000489344 724 ntTSL 213.51□□□□□ -0.256e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 RBM3-201ENST00000354480 1884 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 ZNF223-205ENST00000593088 895 ntTSL 312.52□□□□□ -0.416e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 RBM3-203ENST00000376759 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.466e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC11.45□□□□□ -0.586e-9■■■■■ 47.5
RBM22Q9NW64 ZNF223-201ENST00000434772 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.76e-9■■■■■ 47.5
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