Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IMP3Q9NV31 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IMP3Q9NV31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IMP3Q9NV31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IMP3Q9NV31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IMP3Q9NV31 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms