Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTN9

SEMA4G, Semaphorin-4G, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4GQ9NTN9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SEMA4GQ9NTN9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SEMA4GQ9NTN9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SEMA4GQ9NTN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA4GQ9NTN9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SEMA4GQ9NTN9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEMA4GQ9NTN9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEMA4GQ9NTN9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms