Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSG2

C1orf112, Uncharacterized protein C1orf112, humanhuman

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf112Q9NSG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
C1orf112Q9NSG2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
C1orf112Q9NSG2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C1orf112Q9NSG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1orf112Q9NSG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C1orf112Q9NSG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C1orf112Q9NSG2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms