Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFRSF19Q9NS68 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TNFRSF19Q9NS68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF19Q9NS68 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TNFRSF19Q9NS68 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 838 ms