Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
VPS45Q9NRW7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VPS45Q9NRW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VPS45Q9NRW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VPS45Q9NRW7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
VPS45Q9NRW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms