Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG9

AAAS, Aladin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAASQ9NRG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms