Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG9

AAAS, Aladin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAASQ9NRG9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
AAASQ9NRG9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
AAASQ9NRG9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AAASQ9NRG9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
AAASQ9NRG9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
AAASQ9NRG9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AAASQ9NRG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms