Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDM9Q9NQV7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDM9Q9NQV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRDM9Q9NQV7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDM9Q9NQV7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRDM9Q9NQV7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms