Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS3

NECTIN3, Nectin-3, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN3Q9NQS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NECTIN3Q9NQS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NECTIN3Q9NQS3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN3Q9NQS3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NECTIN3Q9NQS3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN3Q9NQS3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms