Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
CYLDQ9NQC7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CYLDQ9NQC7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CYLDQ9NQC7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CYLDQ9NQC7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CYLDQ9NQC7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CYLDQ9NQC7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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