Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
RTN4Q9NQC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RTN4Q9NQC3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RTN4Q9NQC3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RTN4Q9NQC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RTN4Q9NQC3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RTN4Q9NQC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RTN4Q9NQC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms