Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU1

BARX1, Homeobox protein BarH-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX1Q9HBU1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BARX1Q9HBU1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BARX1Q9HBU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BARX1Q9HBU1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
BARX1Q9HBU1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms