Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EBF2Q9HAK2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EBF2Q9HAK2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EBF2Q9HAK2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
EBF2Q9HAK2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EBF2Q9HAK2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 713.3 ms