Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA38

ZMAT3, Zinc finger matrin-type protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT3Q9HA38 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT3Q9HA38 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZMAT3Q9HA38 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ZMAT3Q9HA38 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZMAT3Q9HA38 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZMAT3Q9HA38 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZMAT3Q9HA38 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZMAT3Q9HA38 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZMAT3Q9HA38 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZMAT3Q9HA38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZMAT3Q9HA38 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms