Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNTD2Q9H8S5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNTD2Q9H8S5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNTD2Q9H8S5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTD2Q9H8S5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTD2Q9H8S5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms