Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7R0

ZNF442, Zinc finger protein 442, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF442Q9H7R0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF442Q9H7R0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF442Q9H7R0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF442Q9H7R0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF442Q9H7R0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF442Q9H7R0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms