Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FNDC4Q9H6D8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FNDC4Q9H6D8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FNDC4Q9H6D8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
FNDC4Q9H6D8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FNDC4Q9H6D8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms