Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V9

CXorf56, UPF0428 protein CXorf56, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf56Q9H5V9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CXorf56Q9H5V9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CXorf56Q9H5V9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXorf56Q9H5V9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXorf56Q9H5V9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXorf56Q9H5V9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms