Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3P2

NELFA, Negative elongation factor A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFAQ9H3P2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NELFAQ9H3P2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NELFAQ9H3P2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NELFAQ9H3P2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NELFAQ9H3P2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NELFAQ9H3P2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms