Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTBN4Q9H254 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPTBN4Q9H254 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPTBN4Q9H254 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPTBN4Q9H254 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPTBN4Q9H254 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
SPTBN4Q9H254 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPTBN4Q9H254 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms