Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF541Q9H0D2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF541Q9H0D2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
ZNF541Q9H0D2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZNF541Q9H0D2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
ZNF541Q9H0D2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
ZNF541Q9H0D2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
ZNF541Q9H0D2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
ZNF541Q9H0D2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF541Q9H0D2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
ZNF541Q9H0D2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ZNF541Q9H0D2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms